MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Runella slithyformis DSM 19594 plasmid pRUNSL03

Total Repeats: 1360

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015694	AT	4	8	2	9	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015694	TTA	2	6	14	19	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015694	TTAT	2	8	43	50	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015694	TGA	2	6	89	94	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015694	AGTT	2	8	194	201	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015694	ATA	2	6	216	221	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015694	ATA	2	6	225	230	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015694	AAT	2	6	233	238	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015694	A	8	8	308	315	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015694	A	6	6	358	363	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_015694	GTAA	2	8	374	381	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015694	AGT	2	6	397	402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015694	GA	3	6	426	431	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015694	TA	3	6	432	437	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015694	TA	4	8	460	467	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015694	AAG	2	6	600	605	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015694	CAAATA	2	12	609	620	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_015694	AT	3	6	679	684	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015694	TGTA	2	8	689	696	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015694	AAAT	2	8	713	720	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015694	AGTGTC	2	12	722	733	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_015694	A	8	8	771	778	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015694	TA	3	6	848	853	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015694	TA	3	6	856	861	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015694	A	6	6	939	944	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015694	TTTA	2	8	1019	1026	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015694	AGG	2	6	1056	1061	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	338209458
28	NC_015694	TGTA	2	8	1095	1102	25 %	50 %	25 %	0 %	338209458
29	NC_015694	TGCTGA	2	12	1131	1142	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	338209458
30	NC_015694	TCA	2	6	1168	1173	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338209458
31	NC_015694	AAG	2	6	1176	1181	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338209458
32	NC_015694	TGA	2	6	1182	1187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338209458
33	NC_015694	A	6	6	1220	1225	100 %	0 %	0 %	0 %	338209458
34	NC_015694	TTA	2	6	1271	1276	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338209458
35	NC_015694	TGC	2	6	1334	1339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338209458
36	NC_015694	ATCA	2	8	1460	1467	50 %	25 %	0 %	25 %	338209458
37	NC_015694	AAG	2	6	1493	1498	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338209458
38	NC_015694	TTCAA	2	10	1525	1534	40 %	40 %	0 %	20 %	338209458
39	NC_015694	TAATG	3	15	1647	1661	40 %	40 %	20 %	0 %	338209458
40	NC_015694	TA	3	6	1672	1677	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015694	TA	3	6	1688	1693	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015694	TA	3	6	1696	1701	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015694	TA	3	6	1704	1709	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015694	TAT	2	6	1732	1737	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338209459
45	NC_015694	AAAT	2	8	1747	1754	75 %	25 %	0 %	0 %	338209459
46	NC_015694	GCC	2	6	1780	1785	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	338209459
47	NC_015694	GAA	2	6	1786	1791	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338209459
48	NC_015694	A	6	6	1821	1826	100 %	0 %	0 %	0 %	338209459
49	NC_015694	AAGGT	2	10	1860	1869	40 %	20 %	40 %	0 %	338209459
50	NC_015694	GAG	2	6	1895	1900	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	338209459
51	NC_015694	TA	3	6	1902	1907	50 %	50 %	0 %	0 %	338209459
52	NC_015694	TACT	2	8	1958	1965	25 %	50 %	0 %	25 %	338209459
53	NC_015694	GAC	2	6	1979	1984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338209459
54	NC_015694	A	6	6	1987	1992	100 %	0 %	0 %	0 %	338209459
55	NC_015694	GGT	2	6	2014	2019	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_015694	TTCC	2	8	2062	2069	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_015694	TTC	2	6	2108	2113	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338209460
58	NC_015694	T	6	6	2134	2139	0 %	100 %	0 %	0 %	338209460
59	NC_015694	ACC	2	6	2152	2157	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338209460
60	NC_015694	TAG	2	6	2189	2194	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338209460
61	NC_015694	A	7	7	2249	2255	100 %	0 %	0 %	0 %	338209460
62	NC_015694	TGA	2	6	2359	2364	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338209460
63	NC_015694	CGTCG	2	10	2575	2584	0 %	20 %	40 %	40 %	338209461
64	NC_015694	TTG	2	6	2696	2701	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338209461
65	NC_015694	TTG	2	6	2795	2800	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338209461
66	NC_015694	AGT	2	6	2811	2816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338209461
67	NC_015694	AAT	2	6	2866	2871	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338209461
68	NC_015694	ATA	2	6	2981	2986	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338209461
69	NC_015694	T	6	6	3009	3014	0 %	100 %	0 %	0 %	338209461
70	NC_015694	AAG	2	6	3026	3031	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338209461
71	NC_015694	T	7	7	3036	3042	0 %	100 %	0 %	0 %	338209461
72	NC_015694	GAA	2	6	3137	3142	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338209461
73	NC_015694	CAG	2	6	3181	3186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338209461
74	NC_015694	CCT	2	6	3218	3223	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	338209461
75	NC_015694	T	6	6	3248	3253	0 %	100 %	0 %	0 %	338209461
76	NC_015694	GT	3	6	3266	3271	0 %	50 %	50 %	0 %	338209461
77	NC_015694	ATT	2	6	3290	3295	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_015694	GAA	2	6	3303	3308	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_015694	TTA	2	6	3324	3329	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_015694	T	6	6	3362	3367	0 %	100 %	0 %	0 %	338209462
81	NC_015694	CTC	2	6	3404	3409	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	338209462
82	NC_015694	TTTTG	2	10	3439	3448	0 %	80 %	20 %	0 %	338209462
83	NC_015694	TGA	2	6	3482	3487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338209462
84	NC_015694	ATA	2	6	3567	3572	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338209462
85	NC_015694	G	6	6	3652	3657	0 %	0 %	100 %	0 %	338209462
86	NC_015694	ATC	2	6	3711	3716	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338209462
87	NC_015694	TTAA	2	8	3721	3728	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_015694	AAT	2	6	3791	3796	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_015694	AAT	2	6	3832	3837	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_015694	TTTAT	2	10	3895	3904	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_015694	CAC	2	6	3948	3953	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
92	NC_015694	C	6	6	3981	3986	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
93	NC_015694	A	6	6	4093	4098	100 %	0 %	0 %	0 %	338209463
94	NC_015694	AGC	2	6	4238	4243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338209463
95	NC_015694	AAT	2	6	4276	4281	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338209463
96	NC_015694	CAAC	2	8	4284	4291	50 %	0 %	0 %	50 %	338209463
97	NC_015694	A	6	6	4374	4379	100 %	0 %	0 %	0 %	338209463
98	NC_015694	GAT	2	6	4388	4393	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338209463
99	NC_015694	AGA	2	6	4460	4465	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338209464
100	NC_015694	TCA	2	6	4495	4500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338209464
101	NC_015694	GATA	2	8	4724	4731	50 %	25 %	25 %	0 %	338209464
102	NC_015694	CAT	2	6	4755	4760	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338209464
103	NC_015694	TGAC	2	8	4801	4808	25 %	25 %	25 %	25 %	338209464
104	NC_015694	GAA	2	6	4838	4843	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338209464
105	NC_015694	GCGG	2	8	4973	4980	0 %	0 %	75 %	25 %	338209464
106	NC_015694	AGC	2	6	5056	5061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338209464
107	NC_015694	A	6	6	5085	5090	100 %	0 %	0 %	0 %	338209464
108	NC_015694	CGGA	2	8	5133	5140	25 %	0 %	50 %	25 %	338209464
109	NC_015694	GGA	2	6	5243	5248	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	338209464
110	NC_015694	A	6	6	5272	5277	100 %	0 %	0 %	0 %	338209464
111	NC_015694	CGGA	2	8	5465	5472	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
112	NC_015694	ATAA	2	8	5539	5546	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_015694	T	7	7	5627	5633	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_015694	GAT	2	6	5653	5658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_015694	GCA	2	6	5688	5693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_015694	A	6	6	5704	5709	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_015694	CAT	2	6	5710	5715	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_015694	CAAAT	2	10	5726	5735	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
119	NC_015694	T	6	6	5795	5800	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_015694	T	6	6	5812	5817	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_015694	ATA	2	6	5839	5844	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_015694	TAT	2	6	5891	5896	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338209465
123	NC_015694	TCA	2	6	5975	5980	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338209465
124	NC_015694	GAT	2	6	5984	5989	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338209465
125	NC_015694	ATT	2	6	6039	6044	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338209465
126	NC_015694	TCAA	2	8	6047	6054	50 %	25 %	0 %	25 %	338209465
127	NC_015694	ATT	2	6	6074	6079	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338209465
128	NC_015694	T	6	6	6115	6120	0 %	100 %	0 %	0 %	338209465
129	NC_015694	C	6	6	6167	6172	0 %	0 %	0 %	100 %	338209466
130	NC_015694	GGA	2	6	6196	6201	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	338209466
131	NC_015694	GAG	2	6	6434	6439	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	338209466
132	NC_015694	AAT	2	6	6464	6469	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_015694	TCA	2	6	6536	6541	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_015694	TAA	2	6	6625	6630	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_015694	CAAT	2	8	6631	6638	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
136	NC_015694	TAT	3	9	6648	6656	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_015694	AAC	2	6	6706	6711	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338209467
138	NC_015694	TGA	2	6	6738	6743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338209467
139	NC_015694	TGTT	2	8	6749	6756	0 %	75 %	25 %	0 %	338209467
140	NC_015694	ATG	2	6	6763	6768	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338209467
141	NC_015694	CTC	2	6	6804	6809	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	338209467
142	NC_015694	AAAT	2	8	6840	6847	75 %	25 %	0 %	0 %	338209467
143	NC_015694	TA	3	6	6848	6853	50 %	50 %	0 %	0 %	338209467
144	NC_015694	CTT	2	6	6893	6898	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338209467
145	NC_015694	TA	3	6	7041	7046	50 %	50 %	0 %	0 %	338209467
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168	NC_015694	TTA	2	6	7975	7980	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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415	NC_015694	GCA	2	6	20498	20503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338209481
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443	NC_015694	T	6	6	21662	21667	0 %	100 %	0 %	0 %	338209484
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